分子の可視化とMVDの結果表示のためのフリーソフト

Molegro Molecular Viewer

Molegro Molecular Viewer は、蛋白質-リガンド相互作用を予測するための統合プラットフォームであるMolegro Virtual Docker のライトバージョン・フリーソフトウエアです。

ドッキングの機能や他の特徴的な機能は利用できませんが、追加ライセンスを購入することなく、他のMVDユーザが生成したドッキングの結果の詳細を表示させたり調べたりすることができます。

もちろん、通常ご使用になる、分子の可視化ソフトウエアとしても非常に高い機能を持ち合わせていますので、Molegro Virtual Docker を現在利用していない方にとっても価値あるソフトウエアと言えます。例えば、PDBエントリーを入力すると自動ダウンロードでエントリーファイルが読み込まれ、様々な方法で描画させることができます。

Molegro Molecular Viewer は、PDB、Mol2、SDFのフィルフォーマットに対応しており、そして、現在一般に利用されている殆どのOS(Windows, Mac, Linux)上で稼働し、さらに、無償です。

Molegro社のサイトよりダウンロードして下さい。

• Molecular Virtual Docker からの実行結果を共有化し、ポーズ情報などの表示が可能
• PDB, SDF, Mol2, MVDML ファイルのインポートとエクスポート
• もちろん、PDBエントリーの直接ダウンロードも可能
• 分子サーフェスとバックボーンの生成と可視化
• 分子表示や表示面のトリミング
• 構造的なタンパク質のアライメント
• 様々な分子プロパティのための高度なテキストラベリング
• カスタマイズ可能な分子サーフェスとバックボーン表現
• 表示した分子構造等を簡単にスナップショットし、JPEG,PNG,BMPで保存
• 対称変換情報を含んだPDBファイルのための、Biomolecule generator

クロスプラットフォームです。Windows, Mac(PowerPCおよびIntel)、Linux(32-bit) に対応。

• Windows 2000, Windows XP, Windows Vista.
• Mac OS X - Intel 及び Power PC : Mac OS X 10.4 and 10.5.
• Linux (32-bit): 主なディストリビューション: Debian, Fedora Core, Gentoo, Red Hat, SUSE, Ubuntu.

ダウンロードは、こちら Molegro社のサイトから。。