ClassPharmer™が、 MedChem Studio™となって新たにリリースされました。 強力なクラスタリング機能に加え、多くの分子設計要素を盛り込んだ、ドラッグディスカバリーのための統合プラットフォームです。
これまでのClassPharmer™の持つ機能を継承しながら操作性能が向上、さらに新たな機能が追加されています。
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Basic Module
直観的なクラス生成
MedChem Studio™のクラス生成テクノロジーは、共通するscaffold構造に基づいて、分子を化学ファミリーへ自動的に分類することによってケミストの論理的思考を再生します。
- フィンガープリントではなく、最大共通部分構造(MCSs: maximum common substructures)を使用しますので、その結果は、化学的にたいへん直観的なものとなります。
- 事前に定義されたリストから骨格構造を読み込むのではなく、そのデータから骨格構造を習得します。そのため、新規の構造モチーフが発見される可能性があります。
- 局所的なQSAR生成, 分子設計, その他の分析的な課題に対して、理想的な出発点を提供します。
容易なR テーブル生成
MedChem Studio™では、入力に分子のリストを用いるだけでRテーブルを作ることが可能です。
- 骨格構造とRグループが、自動的に決定されます。
- ひとつの指定したR groupで相違する分子を引き離すことにより、SARを抽出することが可能です。
- R group pairs により、分子特性や活性について、置換効果を可視化することできるようになりました。
- それぞれ全体にカスタマイズ可能なテーブルとして、Excelや他のソフトウエアにエクスポートすることが可能です。
データ検索と類似度スクリーニング
MedChem Studio™のクエリー機能により、ISIS/DrawやChemDrawからペーストした構造を用いて、データの検索が可能です。また、シミラリティ機能では、興味の対象となるリファレンス分子に構造上類似しているすべての分子を素早く同定することを実現しています。
- 類似度の距離関数やフィンガープリントタイプを修正することによりスコアをカスタマイズします。
- 分子の強調表示を通してスコアの構造基盤を表示します。
- オープンドキュメントや外部ファイルにある分子を用いて類似度の計算を行うことができます。
Basicモジュールが提供するその他の機能:
- データの可視化
- フィルタリング
- 最大共通部分構造 (Maximum Common Substructures)
- 分子の標準化
- 2D座標の発生
- 正規化
- コマンドラインオプション
- Pipeline Pilot™ モジュール
- ISIS/Draw™, ChemDraw™, Microsoft® Excel™ などとの統合
問合せ先：
〒060-0002 札幌市中央区北2条西2丁目1-5 リージェントビル
Tel 011-223-7456
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